Anaconda介绍

Anaconda（官方网站）就是可以便捷获取包且对包能够进行管理，同时对环境可以统一管理的发行版本。Anaconda包含了conda、Python在内的超过180个科学包及其依赖项。

套件管理

显示已安装的套件

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conda list
pip list

套件安装

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conda install packages # pip可以安装一些conda安装不了的包
pip install packages [-i https://pypi.douban.com/simple] # -i部分临时指定pip源
easy_install 参数 packages
python setup.py install # 下载源码，进入到源码路径下

国内的pip源

阿里云 https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/

中国科技大学 https://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/

豆瓣(douban) https://pypi.douban.com/simple/

清华大学 https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/

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pip install xx -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host=pypi.douban.com/simple

从Anaconda.org安装套件

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# 如果一个包不能使用conda安装，可在Anaconda.org查找
# 在左上角的叫“Search Anaconda Cloud”搜索框中输入“包名”并点击search按钮
conda install --channel https://conda.anaconda.ort/pandas bottleneck # 安装bottleneck包

删除套件

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conda/pip uninstall packages
easy_install -m packages

查找套件

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conda search packages

pip管理

升级

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# 试用linux, win下可能会因为权限升级失败
pip install --upgrade pip

# win或linux
python -m pip install --upgrade pip

如果不小心删掉了pip，可以用以下命令安装

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python -m ensurepip --default-pip

食用教程

安装

基础准备(centos7环境)

  • 安装wget命令：yum -y install wget

  • 安装git相关

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    # 安装git
    yum install git -y

    # 安装git lfs（大文件下载）
    curl -s https://packagecloud.io/install/repositories/github/git-lfs/script.rpm.sh | sudo bash
    yum install git-lfs
    git lfs install

  • 安装OpenSSL和libssl-dev

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    yum install openssl
    yum install openssl-devel

  • 安装gcc：yum install gcc

安装步骤，附清华大学开源软件镜像站

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# 安装anaconda环境
wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2023.07-2-Linux-x86_64.sh
chmod +x Anaconda3-2023.07-2-Linux-x86_64.sh
./Anaconda3-2023.07-2-Linux-x86_64.sh

# 创建自己的python环境
conda create -n gpt310 python=3.10 anaconda

虚拟环境管理

使用Anaconda Prompt 管理虚拟环境

新建虚拟环境

添加后缀 “anaconda”或“biopython”可以创建一个基本科学计算功能完备的环境

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conda create -n 环境名 python=3.10 anaconda

# 如果需要指定虚拟环境的路径, 可以使用--prefix参数
conda create -n 环境名 --prefix='D:\Program Files\Anaconda4\envs\gpt310' python=3.10 anaconda

切换虚拟环境

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# Linux，OS X
source activate snowflakes
# Windows
conda activate snowflakes

关闭虚拟环境

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# Linux，OS X
source deactivate
# Windows
deactivate

查看所有的虚拟环境名称

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conda info -e
conda env list

移除虚拟环境

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conda remove -n 虚拟环境名称 --all

复制虚拟环境

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conda create -n 虚拟环境名称 --clone root

IPython 交谈式命令窗口

  • cmd中python模式的加强版

  • 观看先前输入的程序代码 history

  • 查询使用说明 ?加在命令后面

  • 简易智能输入

  • 执行python档案 %run 档案路径

更新conda本身

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conda update conda

更新anaconda 应用

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conda update anaconda

更新python

假设当前python环境是3.6.1，而最新版本是3.6.2，那么就会升级到3.6.2

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conda update python

conda源管理

查看当前源信息

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conda info

关注 channel URLs 字段内容

添加一个镜像

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# 添加镜像
(base) C:\Users\hyc>conda config --add channels 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/'

# 设置搜索时显示channel地址
(base) C:\Users\hyc>conda config --set show_channel_urls yes

删除一个镜像

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# 注意链接要有引号，英文输入法
(base) C:\Users\hyc>conda config --remove channels 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/'

查看conda的镜像

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conda config --show-sources
conda config --show channels

删除所有镜像

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conda config --remove-key channels

以上操作可以直接编辑.condarc文件完成

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ssl_verify: False
proxy_servers:
  http: http://192.168.4.80:3128
  https: http://192.168.4.80:3128
channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - defaults
show_channel_urls: True

其他管理

运行环境分享

执行如下命令可以将当前环境下的 package 信息存入名为 environment 的 YAML 文件中

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conda env export > environment.yaml

使用yaml文件创建环境

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conda env create -f environment.yaml

国内常见源

linux可行

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conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --set show_channel_urls yes